百合品种已达千个，国际百合学会1982年按照亲缘关系划分为8个系列
1、亚洲百合杂种系（Asiatica hybrida）
又名朝天百合，分布在亚洲地区的百合种类及其杂交种杂交产生。
主要亲本：朝鲜百合（L. amabile）、鳞茎百合（L. bulbiferum var. croceum）、L. hollandicum、L.elegans、大花卷丹（L. maximowiczii）、山丹（L. pumilum）、毛百合（L. dauricum、）渥丹（L. concolor）、卷丹（L. lancifolium）、川百合（L. davidii）、垂花百合（L. cernum）
特点：花朵朝上，花色丰富，不香，耐寒
2、星叶百合杂种系（Martagon hybrids）
亲本：星叶百合（L. martagon）、汉森百合（L. hansonii）等。
百合3、白花百合杂种系（Candidum hybrids）
亲本：白花百合等起源于欧洲的百合（不包括星叶百合）
4、美洲百合杂种系（American hybrids）
亲本：L. pardalinum、L.parryi等生长在北美地区的百合
5、麝香百合杂种系（Longiflorum hybrids），又名铁炮百合
亲本：麝香百合、台湾百合等。
特点：花为喇叭筒形，平伸，易感染病毒
6、喇叭百合杂种系（Trumpet hybrids）
亲本：通江百合、宜昌百合（L.leucanthum）、湖北百合、王百合
7、东方百合杂种系（Oriental hrbrids）
亲本：天香百合（L.auratum）、鹿子百合（L. speciosum）、红花百合（L. rubellum）和日本百合（L. japonicum）。
8、其他杂种系(Miscellaneous bybrids)
按花期分类
早花类：种植到开花60～80天，主要为亚洲百合杂种系，Kinks、Lotus、Orange Mountain
中花类：种植到开花85～100天，主要为亚洲系品种，以及部分东方系品种和麝香百合品种，Avigon、Enchantment
晚花类：种植到开花105～120天，主要为东方系品种和麝香百合品种，Olympic Star、Star Gazer
极晚花类：种植到开花120～140天，主要东方系品种和麝香百合品种，Casa Blanca（20周）、Diablanca
常见种类
世界野生百合约有90多种，我国是世界百合起源的中心，据调查我国约有原产百合46种，18个变种，占世界总数的一半以上，其中36种15个变种为我国特有，南平市就有16种，其中野生百合5种、变种1种、变异10种。在山区遍地野生的就有橙红色的卷丹和白色的野百合两种，是我国宝贵的种质资源。美国、法国及荷兰的花卉育种专家多次来南平考察百合花，称赞这些品种是世界上少有的优良品种，具有区域特色和发展潜力
常见盆栽用百合有亚洲盆栽系列
超级康巴斯（CompassSup），株高45厘米，花金橙色，每枝蕾数4～6；
乡情（CountyLife），株高40厘米，花深黄色，每枝蕾数8～10；
伙伴（Partnr），株高40厘米，花深红色，每枝蕾数6～8；
梦幻（Fancy），株高45厘米，花黄色，每枝蕾数4～6；
变色龙（Cameleon），株高45厘米，花金黄色，每枝蕾数6～8；
新波（NewWave），株高40厘米，花纯白色，每枝蕾数7～9；
黑鸟（BlackBird），株高30厘米，花深红色，每枝蕾数4～6；
地平线（Horizon），株高35厘米，花橙色，每枝蕾数6～8。
东方盆栽系列
大道（Boulavard），株高45厘米，花白带黄心，每枝蕾数6～7；
早恋（BabyLove），株高25厘米，花白带黄心，每枝蕾数6～8；
名士（Prestige），株高40厘米，花深红带白边，每枝蕾数9～11；
奇迹（Miracle），株高30厘米，花粉红带黄心，每枝蕾数5～7；
口碑（Alibi），株高25厘米，花白色带黄心，每枝蕾6～10；
情感（Feelings），株高50厘米，花粉红带黄心，每枝蕾数7～9；
帅哥（LittleBoy），株高45厘米，花深粉红色，每枝蕾数5～7；
少女（LittleGirl），株高40厘米，花粉红带黄心，每枝蕾数5～7。
常见百合品种
朝鲜百合(Lilium amabile)、 山百合(Lilium auratum) 、珠芽百合(Lilium bulbiferum) 、布朗百合(Lilium brownii) 、加拿大百合(Lilium canadense) 、白百合(Lilium candidum) 、香水百合(Lilium Casa Blanca) 、加尔亚顿百合(Lilium chalcedonicum) 、渥丹(Lilium concolor) 、台湾百合(Lilium formosanum) 、日内瓦百合(Lilium cv. "Geneve" ) 、星象家百合（葵百合、火百合）(Lilium cv. "Star Gazer" ) 、湖北百合(Lilium henryi) 、洪堡百合(Lilium humboldtii)、荷兰百合(Lilium hybrids) 、卷丹(Lilium lancifolium) 、麝香百合(Lilium longiflorum)、 欧洲百合(Lilium martagon)、 紫斑百合(Lilium nepalense) 、豹纹百合(Lilium pardalinum)、 山丹百合(Lilium pumilum) 峨眉百合(Lilium regale) 、艳红鹿子百合(Lilium speciosum)
阴阳平衡
