红色的玛瑙，即古代的赤玉。红玛瑙中有东红玛瑙和西红玛瑙之分。前者是指天然含铁的玛瑙经加热处理后形成的红玛瑙，又称“烧红玛瑙”，其中包括鲜红色，橙红色。东红玛瑙一名，因早年这种玛瑙来自日本，故而得名。后者是指天然的红色玛瑙，其中有暗红色者，也有艳红色者，中国古代出土的玛瑙均属西红玛瑙，这种玛瑙多来自西方，故而得名。
指蓝色或蓝白色相间的玛瑙。这是一种颜色十分美丽的玛瑙，块度大者是玉雕的好料。优质者颜色深蓝。次者颜色浅淡。蓝白相间者也十分美丽，当有细纹带构造时，则属于缠丝玛瑙中的品种。目前中国市场上产的蓝玛瑙制品，多半由人工染色而成，其色浓均，易与天然者区分。
紫色玛瑙。多呈单一的紫色，优质者颜色如同紫晶，而且光亮。次者色淡，或不够光亮，俗称“闷”。紫玛瑙在自然界不多见，亦有染色。
绿色的玛瑙，自然界不见绿玛瑙，目前中国珠宝市场上的绿玛瑙几乎都是人工着色而成，·其色浓绿，有的色似翡翠，但有经验者很易同翡翠区别。绿玛瑙颜色“单薄”，质地无翠性，性脆;翡翠颜色“浑厚”质地有翠性，韧性大。
黑色的玛瑙。自然界少见黑玛瑙，目前中国珠宝市场上的黑玛瑙都是人工着色而成，其色浓黑，易与其他黑色玉石相混。以其硬度大于黑曜岩等区别。
以白色调为主或五色的玛瑙。其中东北辽宁省产出的一种所谓白玛瑙，其实有的属于白玉髓，多用于制作珠子，然后进行人工着色，可以着色成蓝，绿，黑等色。这种白色玛瑙，大块者也用来作玉器原料，同时在局部染成俏色加以利用。然而，自然界也产出一些白色玛瑙，由于颜色不正，特别那些灰白色者，一般不受人欢迎，但也可以用来制成一些价格便宜的低档的旅游产品或旅游纪念品。
其他颜色的玛瑙 其他颜色的玛瑙，均可按不同颜色加以命名。
水草玛瑙就是天然玛瑙由于形成环境十分特殊，成形后的水草玛瑙里边含有类似草一样的花纹。
近年来随着玛瑙市场的走红，玛瑙中的水草玛瑙的价格更是一路高飙，上涨的空间已经好几倍甚至几十倍。随意买水草玛瑙的时候一定要对它有一点的了解。以免出现高价买个次品。不但浪费钱，说不来还对于皮肤(身体)有害!
水草玛瑙的构成上，首先要确定它是一个整体式的玛瑙原石组成的，下来是水草玛瑙内部的“包裹体”(丝状物)也就是水草玛瑙中的“水草”，它在玛瑙内部像是盆景一样，有着各式各样的造型，而作为水草玛瑙独特的包裹体，他的丝状物分支多而且细，多数像是杂乱无章的水草，这也是水草玛瑙的由来。
水草玛瑙具有很大的地域性，基本上就绝打多数的水草玛瑙都产自亚州南部-印度地区，中国本土这样的水草玛瑙是非常稀少的，所以通常我们也会叫印度水草玛瑙或者印度苔藓玛瑙，当然价格上相对来说会贵那么一点!
阴阳平衡
