石松亚门（Lycophytina）是蕨类植物门下的1个亚门，该科均属土生小型至大型蕨类。该亚门有2目3科8属，分布于世界热带和亚热带，少数达北半球温带，中国有5属。该亚门植物在石炭纪时最为繁盛，有高大乔木及草本，后绝大多数相继绝灭，现存的只有石松目和卷柏目，均为草本。该亚门模式物种是石松（Lycopodium japonicum Thunb. ex Murray ）。