种仁卵圆形或椭圆形，长2-3.5cm，宽1.5-2.5cm。表面灰棕色至暗棕色，有网状沟纹，常被有白色石灰粉；宽端有浅色圆形隆起（种脐的部位）。狭端有暗色下陷处（合点的部位），两端间有明显的纵沟（种脊的部位）。质坚硬，难破碎，碎断面可见棕黄或暗棕色外胚乳向内伸入，与类白色的内胚乳交错，形成大理石样纹理。纵切时可见宽端有小形腔隙，内藏小型干缩的胚，子叶卷曲。气强烈芳香，味辛辣、微苦。以个大、体重、坚实、破开后香气浓者为佳。
种仁黄切面：外胚乳分内外两层，外层细胞扁平，切向延长，内含黄棕色物质；内层细胞长方形，含红棕色物质，伸入内胚乳形成错入组织，其中常有一个维管束，并有多数油细胞散在，油细胞直径42-140cm，含挥发油滴。内胚乳细胞多角形，含多量脂肪油、淀粉粒及糊粉粒，糊粉粒中有拟晶体。内胚乳有含棕色物质的细胞散在。
1、取本品粉末2g，加乙醚8ml，振摇，冷浸2h，取滤液2ml，置蒸发皿中，待乙醚挥散后，加茴香醛的硫酸试液0.5ml，则显粉红色，渐变紫色。（检查挥发油）
2、薄层色谱 取本品粉末1g，加乙醚4ml，冷浸2h，滤过，滤液作为供试品溶液。另取黄樟醚少许，用乙醚溶解后作为对照品溶液。分别吸取供试品及对照品溶液，点样于同一硅胶G（黄岩）薄层板上。以苯-乙酸乙佛（95：5）展开，展距13cm。干后，喷雾5%磷钼酸乙醇溶液，加热，供试品色谱在与对照品色谱相应位置显相同颜色的斑点。
1、肉豆蔻生品入药可滑肠，而面煨肉豆蔻具涩肠止泻之作用。
2、肉豆蔻与草豆蔻：二药皆为种子类药物，同具温中，燥湿，行气之功，但不同点为：草豆蔻功专脾胃，用于寒湿阻滞脾胃，脘腹胀满疼痛，呕吐，泻泄等。肉豆蔻除上述作用外，味兼涩，归大肠经，具涩肠止泻之特性。
阴阳平衡
