卡氏肺孢子菌病（pneumocystosis）是由卡氏肺孢子菌引起的呼吸系统机会感染。卡氏肺孢子菌长期以来被认为属原虫孢子菌纲，但新近基于种系发生学的研究发现，已明确将其归为真菌，故将肺孢子菌病由原菌性疾病划出，归为真菌性疾病。