1．叫姑鱼属和湾(鱼或)属聚类成叫姑鱼亚科，支持国内学者认为该亚科与石首鱼类其他类群亲缘关系较远的观点。叫姑鱼属种间遗传距离大于同科其他属鱼类的种间遗传距离，表明叫姑鱼属较为原始，种间分化早。
2．白姑鱼亚科并非单系。黄姑鱼和浅色黄姑鱼是姐妹群，但与“鮸状黄姑鱼”和双棘原黄姑鱼分处系统树的不同分支。中国双棘原黄姑鱼与尖头黄鳍牙(鱼或)近缘，而“鮸状黄姑鱼”则与眼斑拟石首鱼、有名锤形石首鱼及犬牙石首鱼相邻；中国南海和印度洋的双棘原黄姑鱼或为不同属；支持将“鮸状黄姑鱼”与双棘原黄姑鱼从黄姑鱼属中独立出来的分类处理。截尾白姑鱼与白姑鱼在系统树上处于相邻位置，但种间遗传距离较大，属的单系性尚待验证。浅色黄姑鱼、白姑鱼不同地理种群间均出现较大分化。
3．牙(鱼或)亚科黄鳍牙(鱼或)与中国产双棘原黄姑鱼近缘，而不与牙(鱼或)属聚类。银牙(鱼或)与红牙(鱼或)种间遗传距离小，或为种内差异；二者与居氏牙(鱼或)遗传距离较大，表明太平洋的种类与印度洋的种类分化较早。
4．黄鱼属与梅童鱼属属间遗传距离与本科多数属内种间遗传距离相当，且同属种均未能形成明显单系，或有归并为1属的可能；鮸鱼属与梅童鱼属-黄鱼属位于分子系统树的相邻位置，或支持3属组成黄鱼亚科的传统分类处理；不过该分支自展数据支持不高，该结论尚需进一步的验证。棘头梅童鱼不同地理种群有较大分化。
5．Dendrophysarusselii与石首鱼科各类群的亲缘关系均较远，其准确系统位置尚需进一步研究。石首鱼科初步的分子系统学研究结果表明目前石首鱼科各等级分类群的划分均可能存在问题。解决石首鱼科的系统发育问题，需要更为广泛取样，并采用更多分子标记。
阴阳平衡