每一种海藻都有其固定的潮位,主要和所含色素的种类与含量比例有关,不同色素所须的光线波长不同,随着光线强度及光质的变化,藻类的分布也受影响。一般在较阴暗处或深海中,藻红素与藻蓝素比叶绿素更能有效地吸收蓝、绿光,故只含叶绿素及胡萝卜素的绿藻,其栖息地多靠近水浅之处。而低潮线附近及深海部分则多为红藻类。此外,地形、底质、温度、湿度、盐度、 潮汐、风浪、洋流、污染物、动物掘食、藻类间的相互竞争等因素,也都会影响海藻的生长与分布。
以台湾海边常见的海藻为例,在海水淹不到但浪花可溅及的飞沫带,在秋末至春初时,北部、东北部沿岸主要以头发菜、紫菜、海萝及 铁钉菜为主,在南部及东部海岸则以柔弱卷枝藻、鞘丝藻及海雹菜等为主。这些海藻本身有胶质保护,可忍受长时间的干旱及炙热,常在阳光下曝晒个三、五天,依然不枯不萎,显现强韧的生命力。但到夏季时,飞沫带则是光秃秃一片。
潮间带依潮汐的大潮、小潮变化,分为上部、中部及下部三区。在潮间带上部,多属于绿藻类,常见有膜状的 石莼、管状的石发或丝状的刚毛藻,都是可以忍受强光照射及每日二次涨退潮的干湿变化,尤其在冬、春季时,常在海蚀平台上形成一片青葱翠绿的“绿色地毯”。在夏季,此区和飞沫带一样,岩石上多是裸露光秃,但在潮池内或有遮阴之处,则仍可发现它们的踪影。
在潮间带中部,主要以褐藻类为主,绿藻为辅。冬、春季时,常见有囊藻、团扇藻、水窗藻、栖状褐茸藻、裂片石莼、网球藻等,尤其在三、四月间有浪拍击的地方,北部以小海带的数量最多,到了夏、秋季,这些藻类大多消失不见。
在潮间带下部及低潮线附近,则以红藻类为主。常见的有沙菜、凹顶藻、龙须菜、小杉藻、角叉菜、匍扇藻。尤其在低潮线附近有海浪拍打的地区,则以小 珊瑚藻、边孢藻、 石花菜、翼枝菜、 马尾藻、牛角树、繁枝 蜈蚣藻等最为常见。这些藻类能忍受海浪的直接扑打及海流的冲击,其中,珊瑚藻及边孢藻等,可以从海水中吸收 石灰质蓄积体内,一方面增强骨架,抵抗水流,一方面降低体内有机质的比例,使其它 海洋生物不爱啃食,也有助于珊瑚的造礁。
这些在潮间带五颜六色的藻类,一到夏天,就逐渐消失了,但在潮间带以下,终年为海水所覆盖的亚潮带,则一年四季均可见到各式各样藻类繁生。常见的有马尾藻、松藻、蕨藻、 海木耳、石花菜、 鸡冠菜、 麒麟菜、 海膜、 蜈蚣藻等,尤其马尾藻常在六、七月间大量生长,形成小型的马尾藻海。