DT的病因众多，目前认为DT并非由于气候，食物或水土等因素所致，绝大多数DT具有传染性，其病原有细菌，病毒，寄生虫，真菌等，偶见原虫和蠕虫感染，近年来随着微生物学鉴定技术和分子生物学的发展及应用，临床上又发现不少新的肠道病原体，但仍有20%～35%的腹泻患者未能检出病因，而被称为“非特异性急性胃肠炎”，现将已知DT的主要病原体列举如下。
关于病原学各地报道不一，主要取决于当地流行的致病菌谱，流行菌(毒)株和当地人群的免疫状况，在全世界范围内，产毒性大肠埃希杆菌(ETEC)被认为是最常见的病原菌，占40%～70%(图1)，其高检出率尤以非洲和中美洲为甚，最近有报道称黏附-积聚性大肠杆菌(EAEC)在世界范围内是仅次于ETEC的旅行者腹泻的病原体，志贺菌属在世界范围内也相当常见，空肠弯曲菌则多见于前往亚洲的旅行者，虽然霍乱在印度次大陆和拉丁美洲是一种重要的腹泻性疾病，但它很少侵扰旅行者，泰国的气单胞菌属特别常见，在东南亚的沿海地区，副溶血弧菌比较多见，旅行者偶可因病毒，原虫和蠕虫的侵袭而发生腹泻，但三者加起来只占旅行者腹泻病因的10%～15%，国内有学者对来自全国18个省，市，自治区237例旅行者腹泻患者进行病原学及感染因素调查，共检出致泻菌14种118株，检出率为49.79%，以致病性弧菌，致泻性大肠埃希杆菌及变形杆菌为主，分别占52.54%(62/118)，16.95%(20/118)和13.56%(16/118)，1999～2001年，西班牙巴塞罗那一所医院对863名旅游者腹泻病人进行调查，在18名病人中检出气单胞菌18份(2%)，应引起人们重视，近年来病毒引起的DT已引起人们的重视，尤其是儿童和婴幼儿的DT，据估计约70%系病毒感染所致，Dupont报告美国去墨西哥的留学生中DT的病原体轮状病毒占10%。
多种病原体的混合感染为10%～33%，泰国在35例DT中有33%病例检出2～4种病原体，其意义尚难确定，此外，尚有l0%～30%的病例未检出病原体，腹泻原因可能是饮食习惯的改变及非病原体因素。
阴阳平衡