慢性结肠炎属自身免疫性疾病，可能与某些病原体感染、遗传基因及精神因素有关，大多病程长，病情缠绵难愈，尤其是溃疡性结肠炎，大便带粘液和脓血，患者十分痛苦，这些症状不是通过调理脾胃、健脾益肠就能解决的，而应寒热通补、健脾和中、燮理阴阳。可采用中西医结合治疗。
一、自身免疫力低下。根除办法应当增强人体的营卫能力。平时要多食富含营养素的绿色素菜水果，肉类食物少吃。也可另食营养补充品。如：花粉。
二、病原体感染。病原体感染也是自身免疫力低下引起感染的。根除方法两部，一部是增强人体免疫力，增加白细胞。二部是人体淋巴排毒。淋巴排毒可以排出病原体分泌的毒素，抑制病原体的生存环境，减缓病原体繁殖，在白细胞与病原体数量上此消彼长下，在结肠炎上的病原体必然会被消灭。
三、遗传基因和精神因素。生活压力不要太大，心情保持愉快，只要不产生有利于遗传基因和精神因素复发的环境，加上一和二的方法，结肠炎通过身体自然恢复必然会慢慢康复的。
中国的医学，自古以来便以其独特的思维方式来解释穴道疗法的效果。在《黄帝内经。素问》中就有记载“气血不顺百病出”的句子。所谓的气血，就是支配内脏的一种能量，而这种能量若流动混乱，就会引起各种疾病。
穴道就是位于能量流动的通路上。这种通路称为“径路”，穴道的正常称法应是“经穴”。内脏若有异常，就会反应在位于那有异常的内脏径路上，更进一步地会反应在能量不顺的经穴上。因此，通过给予穴道刺激，使能量的流动顺畅，而达到治病保健的功效，这就是穴道保健治疗的目的了。
穴道保健治疗法对疾病的治疗，的确有极高的效果，而且，也逐渐借科学的方法剖析其效果。
其结论是：穴道疗法之效能是借刺激穴道而调整自律神经达到健体强身为目的的运动。中医认为体内循环系统发生紊乱，就会生病，而这所谓能量紊乱的状态，换句话说，就是自律神经平衡失调的状态。
结肠炎排泄系统
（1） 饮食：充分休息，避免疲劳和精神过度紧张。给刺激性少的容易消化营养丰富饮食，尽量避免含粗糙纤维食物，暂时不吃牛奶和乳制品。适当补充液体和电解质，补充维生素乙和钙。服铁制剂和叶酸治疗贫血。病情严重，腹泻频繁，营养严重不良的病人，可给一时期胃肠要素饮食或胃肠外营养。
（2） 抗感染药：水杨酰偶氮磺胺吡啶对治疗各部结肠炎，防止并发症有较好疗效。有的引起恶心、呕吐、头痛、皮疹、粒细胞减少、贫血和肝功能不良。如不见效和有不良反应，可改用甲硝哒唑。新霉素和酞磺噻唑也有效用。
（3） 激素治疗：肾上腺皮质激素、氢可的松和强的松可改进全身状况，使病程缓解，排粪次数减少，复发症状减轻和食欲增加。但也有的病人效果不好，并可使溃疡穿孔，出血和愈合缓慢。现在认为应用范围较小，对于急性暴发性或早期发作严重的病人可使症状明显减轻，病情好转；对于长期反复发作的效果并不满意；促皮质激素单位溶于葡萄糖溶液，静脉滴注，症状改进后改用肌肉注射。氢可的松静脉注射，症状缓解后逐渐减量，可给药。皮质激素对缓解症状比可的松效用较好，但维持缓解的效用不如可的松。这种治疗如症状无改进，不应继续超过2周。
（4） 免疫抑制药：硫唑嘌呤，每日1次，可改变病的进程，抑制临床表现，但不能改变基础病，常用于静止期减少复发，也可能中毒，应加注意。6硫基嘌呤（6-MP）与激素合用可减轻症状。
（5） 止泻药：可减少排粪次数，减轻腹痛，常用复方苯乙哌啶、可待因和复方樟脑酊。止泻药物对急性发作的溃疡性结肠炎可能引起中毒性巨结肠，应慎重使用。也可给镇静药物和解痉药物。
（6） 保留灌肠：常用于直肠和乙状结肠炎，可减轻症状，促使溃疡愈合。
（1） 干细胞治疗优势效果明显：治疗后1-4周，食欲不振、乏力、腹水等症状减轻甚至消失;4-12周，干细胞开始分化，白蛋白等生化指标有时明显改善;3-6个月，受损肝组织逐步得到修复，肝功能逐渐恢复，患者体征可获全面改善。
（2）干细胞治疗优势费用低廉：一般国内实施干细胞治疗手术的费用和活体肝移植相比，仅相当于其费用的1/10左右，而实质性改善状况尤其是远期效果并无特别差异。所以被人形象地喻为“平民化的肝移植”。
（3）干细胞治疗优势技术风险小：手术本身过程并不复杂，加上采用的是介入微创手段，而且移植对象来自于患者本人，或脐血干细胞抗原性很低，所以不会产生肝移植那样的排异反应。身体条件好些的，做完后观察数日即可出院。
其他治疗
一、休息：休息对疾病有很大好处，特别对活动期病人要强调充分休息，减少精神和体力负担。随病情好转可逐渐增加活动量，但一般应避免重体力活动。
二、饮食和营养：腹泻期要注意补充营养，又要适当减少饮食中的纤维素成份，像韭菜、芹菜、蒜苔等，要用少渣饮食，以减轻高纤维素成份可能给结肠粘膜带来的机械性损伤。关于结肠炎患者喝牛奶的问题，要看喝牛奶后有无腹泻加重，因为溃疡性结肠炎病人可能对牛乳蛋白过敏，另一方面，有些患者可能因肠道的乳糖酶缺乏服牛奶腹泻。在我国，患有乳糖酶缺乏症的人要比西方为多，因此，对腹泻期的炎症性肠病患者应仔细询问有无对牛乳过敏史，限制乳制品的摄入，有时会起到止泻的效果。
由于腹泻便血、长期摄食过少和吸收营养不良等因素，患者可能有缺铁、叶酸缺乏或贫血、应给予适量补充。一般可经口服或注射补充，运用益气健脾、养血补肾中药也可达增加体质和补充营养的目的，但不要滥补，要辨证用药。长期腹泻者，要补充钙以及镁、锌等微量元素。
慢性结肠炎的治愈标准，一般来说，必须是大便完全恢复正常，日行1次或隔日1次，粪便成形，不再出现粘冻和腹痛等症状，并经内镜检查，证实结肠粘膜的充血、水肿已经消除时，这时结肠炎才达到临床治愈标准。临床上有不少患者自我感觉症状消失，自己主张停药，这时未经内镜检查，其实疾病还没有完全治愈，这样停药就容易复发的，建议在医生的指导下合理用药，达到临床治愈标准，并长期保持良好状态。
1．腹泻就是结肠炎——盲目服药
2．结肠炎应该消炎一滥用抗生素
3．用药见效后未能巩固——中途停药
4．只重视药物治疗——忽视营养补充和心理调适
注：因字数限制，详细资料请参见参考资料8。
预防
①注意饮食有节，预防肠道感染。
②对患者进行心理治疗和控制饮食。
③腹痛腹泻者，宜食少渣、易消化、低脂、高蛋白质。有些不耐受的食品如虾蟹、牛奶、花生等尽量避免食用。
结肠炎④忌食辛辣冰冻、生冷食品，戒除烟酒。已病后的预防（预后）：轻、中度患者预后较好，重型、暴发型患者易合并消化道出血而致休克，特别是急性结肠扩张，死亡率高，预后差。慢性持续、长期腹泻、病变广泛者应注意结肠癌的发生。
慢性结肠炎实际上是各种病因引起慢性腹泻的一种综合征。其中以肠易激综合征、肠道菌群失调、慢性痢疾、早期溃疡性结肠炎、吸收不良综合征等疾病最为多见。患者除应避免精神紧张、腹部着凉，不食生冷，刺激性、不耐受性食物外，可对症选用一些药物。如舌下含服硝苯咛可抑制异常的胃结肠反应、缓解腹痛；腹泻可选用肠宁丸、易蒙停或苯乙哌啶以减少便次；腹胀可用吗叮啉、薄荷油胶丸或消胀片；便秘多食用麦麸、芹菜、包菜、萝卜等高纤维素食物。
有关研究人员发现一种细胞呼吸酶（CYP4B1） 表达量的增加是咖啡酸可以抑制小鼠结肠炎的一个重要指标，咖啡酸是一种抗发炎的抗氧化物，普遍存在于食物中。CYP4B1是一种细胞呼吸酶，在其他模式已被报告和过敏发炎的消退有关，在结肠炎的组织伤害由病理的观察发现，咖啡酸的处理可以抑制结肠炎，并和使CYP4B1回复到正常的表达有关。和芸香素，一种生物类黄酮，及一种非洲马铃薯萃取物比较，三种物质都有抗发炎的效果，抑制骨髓过氧化酶、IL-17、及iNOS的产生，增加IL-4的量，这些都是发炎的相关因子，但只有咖啡酸可以保护葡萄聚醣硫酸盐诱发的结肠炎。
阴阳平衡