一般的病因是机体应激反应与心理因素相互作用的结果,不同的个体都可能涉及遗传、环境、心理、社会和胃肠感染等因素,导致胃肠动力改变、内脏高敏感、脑一肠轴相互作用的紊乱、自主神经和激素的变化等,伴有精神障碍(如恐慌、焦虑、创伤后应激紊乱等)、睡眠障碍和心理应对障碍的患者,应激性生活事件常可导致症状的加重,但对心理因素与IBS之间的确切联系还不十分清楚。研究发现有1/3的IBS患者有胃肠道感染史,国内外都强调精神心理因素对IBS发病的影响,更加重视神经肽类和相关受体功能在IBS发病机制中的作用;近些年人们加强了IBS与炎症性肠病(IBD)之间的联系研究,少数学者甚至认为IBS为IBD的前期表现。