诊断

对急慢性腹泻病因不明，按细菌性痢疾治疗无效者，应考虑原虫性腹泻的可能性若患者有与猪密切接触则应高度警惕本病存在。粪便或肠黏膜组织活检发现本虫滋养体或包囊即可确诊。结肠小袋纤毛虫可在多种溶组织内阿米巴培养基中生长，必要时可取新鲜粪便进行培养帮助诊断。

鉴别诊断：

本病须与阿米巴痢疾、细菌性痢疾、梨状鞭毛虫病、非特异性溃疡性结肠炎、肠结核等病相鉴别。