小袋纤毛虫病结肠小袋纤毛虫首先由Malmsten于1857年在2例急性痢疾患者粪便中发现，随后Leu Kart在1861年在猪大肠中同样发现本虫，1862年，Stein将其归入小袋属并命名为结肠小袋纤毛虫，其分类学地位为原生动物亚界，纤毛门，动基裂纲，前庭亚纲，毛口目，毛口亚目，小袋属，结肠小袋纤毛虫（Balantidium coli）。
1.形态
结肠小袋纤毛虫是目前发现惟一寄生于人体的纤毛虫，也是寄生在人体中最大的一种原虫，其生活史包括滋养体和包囊两种基本形态。
（1）滋养体圆形或卵圆形，无色透明或淡灰略带绿色，大小约（30～200）μm×（25～120）μm，腹面略扁平，背面隆起，虫体表面有嵴状隆起和沟状凹陷，自前方伸向后端，嵴状隆起表面有皱褶，沟状凹陷即位于两嵴之间，体表纤毛均从小沟伸向体外，纤毛摆动可使虫体前后运动，虫体表面有表膜覆盖，下方为透明的外质，内侧为内质，虫体前端略尖，其腹面有一个由表膜内陷形成的食物泡，食物在泡内消化，残余物质通过虫体后端小而不明显的三角形胞肛排出体外，滋养体有电子致密小体，胞质中还有两个伸缩泡（contractile vacuole）可调节渗透压，胞质中还含有多糖颗粒，食物泡等，线粒体分布在虫体外周。
（2）包囊圆形或卵圆形，大小约40～60μm，囊壁厚而透明，淡黄色或浅绿色，新鲜包囊内可见活动的滋养体，包囊对外界环境有较强的抵抗力，在室温下可活2星期至2个月，在直射阳光下经3h后才死亡；对于化学药物的抵抗力也较强，在10%甲醛溶液中能活4h。
阴阳平衡