在抗结核药出现之前,肠结核预后差,死亡率高,抗结核药在临床广泛应用以后,使肠结核的预后大为改观,特别是对黏膜结核,包括肠结核在内的疗效尤为显著,本病的预后取决于早期诊断及时治疗,当病变尚在渗出阶段,经治疗后可完全痊愈,预后良好,合理选用抗结核药物,保证充分剂量与足够疗程,是决定预后的关键。