根:根白色,弦线状,侧根少而短。根的数量、长度和粗度,随植株的发生总叶数的增加而不断增长,大葱发棵生长旺期,根数可达100多条。
茎:茎极度短缩呈球状或扁球状,单生或簇生,粗1~2cm,外皮白色,膜质,不破裂。上部着生多层管状叶鞘,下部密生须根。当苗端生长点分化为花芽后,会逐渐发育除花茎。大葱花茎粗壮,中空不分枝,长30~50cm。
叶:叶由叶身和叶鞘组成,叶身长圆锥形,中空,绿色或深绿色。单个叶鞘为圆筒状。多层套生的叶鞘和其内部包裹的4-6个尚未出鞘的幼叶,构成棍棒状假茎。
花:着生于花茎顶端,开花前,正在发育的伞形花序藏于总苞内。营养器官充分生长的葱株,一个花序有花400-500朵,多者可达800以上。两性花,异花授粉。每朵花有花被6片,雄蕊6枚。雌蕊成熟时,花柱长1cm。子房上位,3室,每室2粒。
果实种子:果实为蒴果,成熟时易开裂。种子盾形,黑色,具6棱,有不规则密皱纹。千粒重2.4-3.4g。