腐败病
初期叶淡绿色，从边缘开始干枯，后全叶卷曲干枯，柄顶弯曲干枯，全田一片枯黄似火烧状。防治：重病田实行2-3年轮作。常用70%甲基托布津1000倍液或75%百菌清800倍液喷雾闷种，盖农膜密闭24小时，晾干后种植。藕田栽前进行深翻并亩施石灰100公斤。发病时可用75%百菌清0．5公斤加干泥土30公斤拌匀撒入浅水田内。因为藕腐败病的病源在茎的泥土部分，防治此病必须喷施茎下部，只留3-5厘米深的水，3-5日连续防治两次，即可防治。
藕黑斑病
黑斑病（又称褐纹病、叶斑病）
初期呈针尖状黄褐色小斑点，后期全叶布满病斑有轮纹，致使半叶或全叶干枯。防治：增施磷钾肥，避免偏施氮肥。冬季田间彻底清除病残叶并集中烧毁。发病初期摘除病叶并喷药防治。常用70%甲托1000倍液或65%代森锌600倍液。或1∶1∶166-200倍波尔多液，每隔10天喷一次，共防2-3次。
病毒病
受害后的荷叶及地下根茎上均可表现症状，叶片上产生大型多角形至不整齐形淡褐色枯斑。根茎表皮产生暗褐色炭疽条斑。防治：选用抗病品种，及时防治蚜虫（传毒媒介）。发病初期喷1．5%植病灵乳剂1000倍液。
叶枯萎
受害荷叶焦黄、枯萎，影响藕生长，造成减产。防治：保持藕田清洁，防止油污污染藕田。污水，肥皂水也会导致荷叶枯萎死亡。藕对除草剂十分敏感。藕田绝不能施用除草剂。
害虫
有蚜虫、斜纹夜蛾，刺蛾等。危害立叶和花蕾。可用90%敌百虫800-1000倍液或40%乐果2000倍液喷洒。水蛆吮吸藕根、茎、叶的汁液。导致荷叶发黄，一旦发现，可施石灰驱杀，亩用量10-15公斤。
阴阳平衡