主要有四点原因:
藤枣
其一,为直接受害,即因其具有较高的经济价值而成为一些人的直接砍挖对象,对其不加控制的滥砍滥挖,此为濒危的最主要原因。逐渐减小的居群又因其遗传多样性的降低从而加速了一个个居群的灭绝,如:海南粗榧、旱地油杉等。其二,为间接受害,由于人们对其他植物或土壤的破坏作用而使其所生存的环境逐渐恶化,退化的生态条件已不能使其正常的生存繁殖,如:原始观音座莲等。
其三,是自身原因,即植株自身的繁殖力和迁移力低下,导致居群年龄结构老化,更新困难,植株数量逐渐减少,如:藤枣、梵净山冷杉等。
其四,为开发建设对植物的破坏。如,三峡工程使得荷叶钱线蕨数量急剧减少,已进入濒危状态。