石松含多种生物碱,统称石松生物碱,已知有石松碱(lycopodine)、棒石松碱(clavatine)、棒石松毒(clavatoxine)、棒石松洛宁碱(clavolonine)、石松灵碱(lycodoline)、法氏石松碱(fawcettiine)、去乙酰墓法氏石松碱(deacetylfawettiine)、法氏石松明碱(fawcettimine)、石松浮莱西宁碱、(lycoflexine)、二氢石松碱(dihydrolycopodine)、乙酰二氢石松碱(acetyldihy-drolycopodine)和N1-去甲基-α-玉柏碱(N1—demethyl—α-obscurine)以及烟碱等。Oxoserrat—14—cne—3β—,21α—diol)(1—21)及其两种差向异构体,还有锯齿石松—14—烯—3β,21,24—三醇(serrat—14—ene—3β,21α,24—triol)(1—22)[40—41]。另据报道从其叶中分得一黄酮甙:芹黄素—4′—O—(2″,6″—二—O—对羟苯丙烯酰基—β—D—吡喃葡萄糖甙[apigenin—4′,-O-(2″,6″-di-O-P-coumaroyl-β-D-glucopyranoside)]。