诊断:由于棘阿米巴性巩膜炎少见,常误诊,即使首先考虑巩膜棘阿米巴感染,诊断仍很难证实。详细询问病史,裂隙灯检查,对涂片或活检组织进行特殊染色和用大肠杆菌性无养分培养基培养,可以早期诊断。常规角膜上皮涂片找不到棘阿米巴或棘阿米巴培养阴性,因为棘阿米巴仅存在于角膜基质内。实验室检查:用活检标本、接触镜及接触镜清洗液、保存液,在室温下,放入用大肠埃希杆菌如大肠埃希菌(Escherichia coli)、产气杆菌(Enterobacteraerogenes)、Klebsiella 肺炎杆菌(Klebsiella pneumoniae)等制备的无养分琼脂培养基中有时仅24h 即可使棘阿米巴生长阳性。其他辅助检查:1.共焦激光显微镜 可发现阿米巴滋养体和包囊。2.角巩膜活检 必要时可以进行。棘阿米巴可直接侵犯巩膜组织,同时伴以多形核白细胞为主的炎细胞浸润,有少量的巨噬细胞和淋巴细胞。活检组织还可以用姬姆萨染色、Masson 三重染色法(Masson trichrome)、GMS、Wright 染色、CFW 和荧光素标记抗体染色可找到阿米巴。