BE本身并无症状,其症状主要是由于胃食管反流及其并发症所引起的多数患者最初有GERD症状如胃灼热反流吞咽困难常见症状多见于餐后及做某些动作引起反流时弯腰腹内压升高或夜间睡眠时可出现胸骨后烧灼样不适以及胸痛胸痛可表现在剑突下或胸骨后疼痛性质可呈烧灼样针刺样或类似心绞痛疼痛可通过饮食或服用抗酸药物缓解多数BE患者没有因食管症状而就诊
一般来讲BE的症状比无BE的胃食管反流病症状要轻原因是Barrett上皮比鳞状上皮更耐受消化性酸的侵袭反酸反胃是严重胃食管反流症状胃肠内容物反流入食管可进入口腔口内可有酸味或苦味出现口臭味觉损害咽痛慢性咽炎声嘶牙釉质腐蚀等现象反流症状的轻重与BE程度无确定关系部分患者有贫血或上消化道出血如出现食管溃疡和狭窄则表现为吞咽痛和相应的梗阻症状吞咽困难的原因可能为鳞状上皮与柱状上皮交界处狭窄慢性食管炎所导致的食管壁纤维化食管蠕动功能减弱急性炎症引起的食管痉挛或柱状上皮癌变腺癌引起的食管腔梗阻还有患者伴有严重反流表现为呼吸系统并发症如反复哮喘发作慢性支气管炎吸入性肺炎和肺间质纤维化等