人类是流感嗜血杆菌的惟一宿主,它寄居于正常人的上呼吸道,无荚膜型菌株和b型流感嗜血杆菌均视为上呼吸道的正常菌群。鼻腔带菌率为25%,喉部带菌率为45%,大多为无荚膜型菌株,3%~15%为b型流感嗜血杆菌,但在婴幼儿集聚的机构,鼻咽部b型流感嗜血杆菌的带菌率高达58%,在成人患有慢性肺部疾病、心脏病、低丙种球蛋白血症和长期吸烟人群中,鼻咽部分分离到b型流感嗜血杆菌的机会增多。本病具两个高发年龄组,即6个月~5岁的婴幼儿组和有基础疾病的成人组。男女均可发病,在婴幼儿组男女之比约1.5∶1,成人组男女相当。秋冬季为发病高峰季节,常发生于上呼吸道感染之后。某些呼吸道病毒如流感病毒可促进流感嗜血杆菌肺炎的发生,尤其在流行性感冒流行之际,流感嗜血杆菌肺炎的发病率增加且病情严重。1892年Pfeiffer观察到此现象,并首次从流感患者的鼻咽分泌物中分离出流感嗜血杆菌,被误认为流感的病原菌而定名沿用至今。