本病之溃疡皆为多发,最多见累及空肠,其次为回肠,偶有发生于十二指肠或结肠者。溃疡一般较深,达到肌层,故易引起穿孔或浆膜面瘢痕挛缩。显微镜下可见小肠绒毛萎缩,溃疡底部及周围可见淋巴细胞、浆细胞、组织细胞和中性粒细胞浸润。溃疡边缘有时可见胃黏膜化生。溃疡与溃疡之间的肠黏膜正常或呈炎症改变。