溃结治疗应采用综合疗法，包括休息、饮食调节进少渣饮食，忌食乳类及过敏食品，重得应行肠外营养（TPN），纠正水电解质紊乱，补充蛋白质，改善全身状况，解除精神因素及对症治疗。
一.溃结的药物治疗
1.柳氮磺胺吡啶（SASP）类 SASP治疗溃结已多年，口服4～6g/日，64%～77%患者疗效良药苦口好，症状缓解后以2g/日维持，至少1年，89%的患者可保持无症状。SASP用量大时疗效提高，但副作用亦增加。SASP到结肠后被肠内细菌偶氮还原酶裂解为5-氨基水杨酸（5-ASA）和磺胺吡啶，前者为有效治疗部分，后者为引起副作用因素。若仅服5-ASA因被上消化道吸收，无足量药物到达结肠，而难生疗效。近年研制了5-ASA口服新剂型如潘他沙（Pentase）、 Ascol、奥柳氮（Olsalazine）、 Poly-5-ASA、Balsalazide等，由于不含磺胺吡啶，副作用降低。近年不少学者注意到局部给药能减少副作用，如应用SASP或5-ASA肛栓或灌肠剂，局部药物浓度提高并维持时间较久，使疗效提高。尚有报告局部用药与全身治疗，有协同作用，可减少SASP口服量。其治疗机制与抑制白叁烯、前列腺素等的产生，亦可抑制自由基等有反应，尚有皮疹、粒细胞减少、肝肾损害及胰腺炎等，其发生率与用量成正相关。
2.4-氨基水杨酸（4-ASA） 又称PAS，系一抗结核药，以2g溶于100ml水中，每日保留灌肠1次，治疗8周有效率达83%。Ginsberg等报道4-ASA每日分次口服4g，经12周治疗，55%患者疗效良好。4-ASA对溃结治疗的机制尚不明。
3.肾上腺皮质激素 能降低毛细血管通透性，稳定细胞及溶解体膜，调节免疫功能，减少巨噬细胞及中性白细胞进入炎症区。能阻滞白叁烯、前列腺素、血栓素等形成，降低炎症反应，而使溃结临床症状迅速改善。一般活动性溃结口服的松40～60mg/日；病情重口服疗效不佳者，可静脉滴注琥珀酸氢化考的松200～300mg/日，或以琥珀酸氢化考的松100mg加入100ml液体中直肠滴注，优于保留灌肠。
糖皮质激素长期应用，易生副作用，故待症状好转后应渐减量，经2～3个月停药，对溃结缓解率约为55.7%～88.2%，长期持续应用糖皮质激素维持治疗，并不能防止复发。近年一些新型皮质激素如丁地去炎松（Budesonide）、巯氢考的松（Tixocorto pivalate）等，无全身副作用，灌肠治疗溃结，疗效优于其他皮质激素。有人用丙酸氟替卡松（Fluticason Propionate）系一口服后全身生物利用度低的含氟皮质类固醇，具有不易被吸收，大部到达结肠的特点，以每次5mg每日4次口服，共4周，其疗效因用量小较泼尼松稍差，如提高用量疗效亦提高，但很少有副作用。尚有糖皮质激素泡沫剂（Foam），小剂量直肠注入与大剂量氢化考的松保留灌肠疗效相等，较灌肠方便。
4.免疫抑制和免疫调节剂 当糖皮质激素治疗不佳或不能耐受其副作用时，可选用硫唑嘌呤、环磷酰胺、6-MP等；近年应用氨甲喋呤、环孢素-A（Cyclosporin-A）10mg/kg，有时获良好疗效，但这类药均有一定副作用应慎用。亦有报道应用青霉胺、左旋咪唑、干扰素、7S-γ球蛋白等，有一定疗效。
5.鱼油（Fish oil）为白叁烯合成抑制剂，口服鱼油辅助治疗轻、中度活动性溃结，可获临床改善。有报道在用糖皮质激素、SASP治疗的同时，辅以口服鱼油5.4g/日，可提高疗效。
6.灭滴灵 可抑制肠内厌氧菌、减轻溃结症状。另外，灭滴灵有影响白细胞趋化性及某些免疫抑制作用，对溃结有一定疗效。但用量大、用时较久，易生胃肠反应。
7.色甘酸二钠 能稳定肥大细胞膜，阻止脱颗粒，抑制组织胺、5-羟色胺、慢反应物质等介质释放，减轻抗原-抗体反应对肠壁损伤。200mg/次，每日3次餐前服；或600mg保留灌肠，有报道与强的松 20mg疗效相似。
8.抗感染药 对有并发感染者，应有针对性选用抗生素，但不宜作为常规用药，以免改变患者对SASP的疗效和反应。
9.其他药物 ①可乐定（Clonidine）有抑制肾素及一些神经介质释放作用，口服0.15～0.225mg/次，每日3次，对溃结有疗效。②钙通道阻滞剂如异搏定、硝苯吡啶，具有止泻、止痛和抑制分泌等作用。桂利嗪50mg，每日口服4次，亦有较好疗效。③甲氰咪胍、雷尼替丁等H2受体阻滞剂，通过抑制肠壁肥大细胞释放组织胺，减少溃结便次等症状。④氯喹可能减慢抗原反应，促使肠上皮细胞功能正常，可使溃结症减轻。此外，自由基清除剂超氧化物歧化酶、5-脂氧合酶抑制剂Zileuton(A-64077)、酮替芬（Ketotifen）等，均可使溃结症状缓解。
二.中医治疗
溃结石在中医应属于“泄泻”、“肠”、“休息痢”等范畴。其治则为中医辩证和西医辨病相结合的“整体观念”为指导。因此，治宜攻补兼施，祛邪为主，兼顾培土扶正。以健运脾胃，利湿热为主。祛邪应清热消炎，可选用黄连、黄芩、白头翁、马齿苋、蒲公英、败酱草等；扶正健脾、利湿，可选用党参、黄芪、茯苓、山药、扁豆、苡仁、白术等。再根据患者具体症状，进行加减。有报道参苓白术散合连理汤加减、白头翁合霍朴夏苓汤加减或痛泻要方合白头翁汤加减，治疗溃结，均取得较好效果。
中药灌肠治疗 ①湿热实证者以黄芩15g、10g黄连、秦皮10g、白皮翁30g、白芍15g、白芨15g、石榴皮15g。②脾虚夹温证者以黄芪30g、黄连10g、黄芩10g、马齿苋30g、白芨10g、苍术50g、五倍子5g。上二方均为水煎50 ～100ml，待冷，每晚睡前保留灌肠1次，半个月为1疗程。亦有用锡类散、黄连素、苦参、云南白药，保留灌肠者。
亦有用中成药如结肠宁、补脾益肠丸、结肠炎丸等与西药配合治疗溃结，取得良好效果。
叁.手术治疗
当并发肠穿孔、中毒性巨结肠、脓肿与瘘管形成、顽固性全结肠炎、内科治疗无效或有癌变者，应行手术治疗。
临床痊愈：临床症状消失，乙状结肠镜等检查示肠粘膜病变恢复正常或仅留疤痕，随访1年或以上未见复发。
基本缓解：临床症状基本消失，乙状结肠镜等检查示肠粘膜仅遗留轻度炎症，或近期治愈后于1年内复发。
部分缓解：临床症状明显减轻，乙状结肠镜等检查示病变程度有所减轻，但有复发。
无效：治疗前后症状和体征无改善或无明显改善。
溃疡性结肠炎一般多采用内服药与灌畅相结合：
（1）湿热内蕴
治法：清热利湿，解毒止泻。
处方：白头翁15克，秦皮12克，白芍18克，黄连、黄芩、黄柏、栀子、木通、棕榈炭、川芎、红花各9克，罂粟壳6克，生白芍12克，土茯苓15克。
加减：热盛加银花、败酱草；湿重加厚朴、米仁、茯苓；腹痛剧烈重用芍药。
灌肠方：白头翁、白花蛇舌草、救必应各30克，川连、赤芍、白芍各15克。
用法；每日1剂，水煎服2次。灌肠方，将上方加水煎至200毫升，每天睡前保留灌肠。腹泻重，灌肠后难保留者，可于药液中加藕粉15克，调成糊状再灌，12～15天为一疗程。
疗效：内服灌肠结合治疗30例，结果基本缓解25例，部分缓解4例，无效1例，总有效率为96.7％。单服中药23例，基本缓解3例，部分缓解12例，无效8例，总有效率为65.2％。表明内服药与灌肠相结合治疗较之单服中药疗效为佳。
常用成方：内服方可选葛根芩连合白头翁汤、芍药汤等；灌服方可用锡类散、黄连粉、云南白药等。
（2）气滞血瘀
治法：利气活血，和营止泻。
处方：内服方：桃仁9克，小茴香6克，干姜6克，延胡6克，五灵脂10克，当归12克，赤芍10克，川芎6克，肉桂4克，蒲黄10克，黄芪20克。
灌肠方：赤芍、丹参、益母草各30克，川芎、牛膝、姜黄各20克，乳香、没药、桃仁、三七各15克。
用法：内服药每日1剂，水煎服2次；灌肠剂，水煎至100～150毫升。睡前灌肠，隔日1次，15次为一疗程。
疗效：共治疗48例，其中13例采取内服外用相结合，临床痊愈5例，基本缓解8例，总有效率为100％；35例仅用灌肠方，临床痊愈和基本缓解15例，部分缓解17例，无效3例，总有效率为91.4％。
常用成方：少腹逐瘀汤等。
（3）脾气虚弱
治法：益气健脾，固涩止泻。
处方：内服方：黄芪、党参、白术各15克，延胡12克，炒白芍、木香各9克，赤石脂18克（包煎），茅莓3克，土炒当归6克，儿茶3克（冲服），炙甘草6克。
加减：腹胀纳差加砂仨、厚朴花；畏寒肢冷加干萋、肉桂；便血明显加地榆炭；兼夹湿热加黄连、白头翁、白花蛇舌草。
灌肠方：白头翁30克，黄柏15克，党参30克，黄芪20克，地榆炭20克，白芨15克，青黛20克。
加减：脓血明显加朱砂30克。
用法：内服方每日1剂，水煎分2次服；灌肠方加水至2000毫升，煎至500毫升，每日1次，每次50毫升，保留灌肠，15次为一疗程。
疗效：以上方治疗脾虚型患者311例（包括部分血瘀型患者），临床痊愈130例，基本缓解112例，部分缓解57例，无效12例，总有效率为96.1％。
常用成方：连理汤、四君子汤合四神丸等。
阴阳平衡