根据病史和典型临床表现较易作出诊断第一鳃裂瘘管伴有耳内流脓,易误诊为化脓性中耳炎,因此应注意二者的鉴别第二、三、四鳃裂瘘管在胸锁乳突肌前缘中1/3和下1/3交界处周围有外瘘口,扁桃体窝、梨关窝食道上端有内瘘口,沿外瘘口向上触诊,可触及有坚实条索状物通向高处经瘘口行X线碘油造影,可明确诊断。
应与颈部结核性瘘管、放线菌病性瘘管相鉴别。