根据临床表现及检查进行诊断。
1.急性菌痢普通型主要应与感染性腹泻相鉴别,包括沙门菌肠炎、空肠弯曲菌肠炎、致病性大肠杆菌肠炎等,大便培养应有相应的致病菌;
2.急性中毒型菌痢应与高热惊厥、乙型脑炎和失水性休克相鉴别;
3.慢性菌痢应与慢性非特异性溃疡性结肠炎、慢性阿米巴痢疾和结肠癌相鉴别;阿米巴痢疾一般全身中毒症状轻,粪便呈暗红色果酱样,镜检可见阿米巴滋养体或包含体,可供鉴别;