房室管畸形产生的病理生理改变主要是不同程度的左至右分流。分流量的大小取决于病变的情况。心室间隔完整且无房室瓣关闭不全的病例则仅心房水平存在左至右分流,造成的循环生理影响主要是右心室容量负荷过重,右心室搏出量及肺循环血流量增多,与第2孔型心房间隔缺损相类似;兼有左房室瓣关闭不全者则心脏收缩时,左心室血液返流入左心房,左至右分流量显著增多,左、右心室心搏量均增大。这类病例在早年即可呈现心脏显著增大和心力衰竭。完全房室共道病例由于心室间隔也存在较大的缺损,舒张期左心房血液可流入右心室,收缩期左心室血液可流入右心房,左至右分流量更大,约2/3病例右心室和肺动脉压力接近于体循环压力,肺血管阻力可在出生后1年内迅速增高,右心衰竭更早呈现。晚期病例随着肺血管阻力升高,左至右分流量逐渐减少,最终呈现右至左逆向分流。