诊断鉴别

本病确诊有赖于大便中发现等孢球虫卵囊，取新鲜大便并经硫酸锌漂浮浓集后镜检可以提高卵囊检出率，等孢子球虫卵囊透明度较高，在直接涂片中很容易遗漏，此时可将显微镜光圈缩小直至涂片中其他原虫或细菌轮廓清晰，有助鉴别，鉴别时主要依据为卵囊大小，子孢子数目，子孢子周围是否存在孢子囊等，除大便检查以外，小肠黏膜活检和肠内容物检查，也可能发现等孢子球虫发育的各期形态，十二指肠引流液检查，部分患者亦可获阳性结果。

本病应注意与其他腹泻相鉴别，等孢子球虫病广泛分布于热带和亚热带，尤应与阿米巴痢疾，肠滴虫病，蓝氏贾第鞭毛虫病，隐孢子虫病等区别，惟本病人体感染相当少见。