流感病毒肺炎诊断依赖于流感流行期间发病和典型的临床表现痰液等分泌物以及肺组织中分离到流感病毒，并需排除细菌性和其他病原体感染如流脑军团病、支原体肺炎等继发细菌性肺炎诊断可由痰肺组织、胸腔积液、血等标本的细菌培养证实。