HIV/AIDS肺部各种病原体感染治疗参见各相关章节,其抗微生物治疗与一般患者基本相同,但应注意HIV/AIDS者抗感染化学治疗时毒副反应发生率较高且严重,应密切观察和防范。抗HIV治疗需参照CD4+和病毒含量。若CD4+<500/μl和病毒含量每毫升>500拷贝者有治疗指征;CD4+>500/μl和病毒含量>500拷贝者是否治疗尚无统一意见,若病人合作则可以治疗;CD4+<200/μl而病毒含量低于可检测水平者,不治疗,定期复查。最常用治疗方案是两种核苷酸反转录酶抑制剂(NRTIs)和一种蛋白酶抑制剂(PI)。并发各种严重的细菌、真菌和(或)病毒性感染。