眼眶真菌病发病率极低，常见的致病菌有毛霉菌、曲霉菌和隐球菌，还有放线菌、青霉菌等。当真菌寄生在人体正常组织内时，如鼻窦、结膜囊。一般不致病，当机体免疫力下降、外伤、大剂量皮质激素或广谱抗生素的广泛使用，寄生的真菌可致病。